[期刊点评] 第58期Applied and Environmental Microbiology（IF=5.005）

Applied and Environmental Microbiology（简称AEM）发表对应用微生物研究、基础微生物生态学研究以及具有实用价值的微生物课题的遗传和分子研究有重大贡献的研究成果。该杂志为关键微生物原理，基本微生物过程以及应用和环境微生物学的基本问题提供了新的启示。

AEM发表应用微生物研究的所有方面的描述，微生物生态学的基础研究，以及聚焦于实用价值的微生物主题的遗传和分子性质的研究。研究必须解决突出的微生物原理，基本的微生物过程，或应用或环境微生物学的基本问题。所考虑的主题包括与食品、农业、工业、生物技术、公共卫生、植物和无脊椎动物有关的微生物学，以及与微生物生态学有关的细菌、真菌、藻类、原生动物和其他简单真核生物的基本生物学特性。手稿应该报告新的和重要的发现，促进对微生物学的理解，并在此基础上其他科学家可能建立。为了更好地服务读者，杂志必须只接受那些对应用和环境微生物学领域最有意义的论文。因此，编辑们会拒绝那些虽然科学上可靠，但只是代表其他研究的增量延伸，主要是验证性的，或没有对一个问题进行足够深入的研究的手稿。

AEM欢迎针对自然或实验系统的微生物学和功能的微生物组研究。微生物组研究的性质将决定它将在杂志的哪个部分发表。

生物降解部分描述了用于改变、去除或利用环境或人为化学品的新型微生物过程。

生物技术部分的论文描述了生物的使用和修改，以实现对社会有益的目标。

环境微生物部分涵盖了聚焦于环境中微生物相关研究的手稿。这与微生物生态学部分不同，后者侧重于生态关系，如生物体之间的相互作用，它们的结构和功能在生态系统中的作用，以及群落水平的研究。因此，环境微生物部分的特色文章关注环境中的特定生物，而不是整个群落，以及那些研究没有关注隐含或陈述的潜在生态关系的文章。

酶学和蛋白质工程部分涵盖了与微生物催化相关的广泛主题，包括以下论文: (1)环境或工业上重要蛋白质的结构和功能，以及如何对其进行修饰以实现实际的催化目标; (2)对环境或社会具有重要意义的真菌、藻类和细菌代谢物或毒素的酶学或生物合成。

进化和基因组微生物部分详细介绍新描述的进化过程和微生物之间的进化关系的论文。主题包括微生物的基因组分析和环境中微生物群的宏基因组研究。(元)基因组分析不能为研究系统的微生物学提供重要的新见解，通常不能在AEM上发表。

食品微生物学部分涵盖涉及食品微生物学所有方面的手稿，包括微生物食品病原体，食品微生物生态学，预测食品微生物学，食品发酵，食品腐败，益生菌，益生元。报道益生菌或益生元作用的手稿将为机制提供新的见解。如果工作包括微生物及其毒素或代谢物生产的重要信息，详细描述微生物毒素或代谢物发生的手稿是合适的。本节还包括胃肠道微生物组的研究，因为它与分子毒理学、饮食和营养有关。食品微生物群的分子评估应遵循微生物生态学部分的指南。

遗传学和分子生物学部分包括论文描述遗传组织，表达，突变，和修复有机体与环境或实际意义。

地质微生物部分的手稿必须强调微生物在陆地或水生生态系统的地球化学过程中的作用，包括地下、含水层和海洋环境。主题包括矿化，能量代谢中无机离子的使用，以及在极端环境中的生长。仅与微生物学有边缘联系的地质过程手稿将不符合AEM标准。

无脊椎动物微生物学手稿应该讨论无脊椎动物和微生物之间的相互作用，从共生和互惠到寄生和致病性。描述来自动物、植物或昆虫细胞的代谢物或毒素或这些细胞的生理学的工作的手稿不适合AEM，除非工作涉及微生物群落或单个微生物。

新的微生物学方法必须提供解决基本生物学问题的新途径，并将考虑在AEM上发表，当伴随一个示范应用。对先前描述的技术应用的描述，包括“外源”基因的克隆、扩增和表达，对一个新的微生物属或种的描述，一般不考虑独立发表。描述用于创新工艺应用、开发或增强的工程菌株的构建的手稿必须提供结果，以验证该菌株的实用性、优越性和独特性。

微生物生态学部分涵盖了微生物生态学的广泛主题，包括不依赖培养的分子评估，为以下方面提供了新的见解: (i)微生物的结构-功能关系，(ii)原位条件对群落结构的影响，或(iii)微生物群落组成变化对生态系统功能的影响。不能提供这种见解的系统发育评估通常不能在AEM上发表。

生理学部分处理关于有机体如何适应其环境的变化的问题，包括生物能学，压力，饥饿，代谢挑战，和对营养变化的反应。

植物微生物学部分包括涉及植物-微生物相互作用的所有方面的手稿，包括共生和根际细菌以及植物病原微生物。

公共和环境卫生微生物科主要关注影响人类健康的环境传播微生物。环境卫生微生物学是公共卫生的一个分支，涉及致病微生物在环境中的发生和创造有利于健康的环境。具有人畜共患病性质的微生物或通过水、土壤或环境表面传播的微生物是特别有趣的。

AEM在原核生物的系统分类方面不是专门的，但当系统发育或基因型数据伴随着大量的信息，超出了新分类单元的分类描述时，描述一个新的原核分类单元的分类学论文是受欢迎的。此类其他信息可能包括有关新分类单元的新生态，生理，生物技术或进化特征的信息。新分类单元的描述应包括足以允许新分类单元进行验证的信息量，并且必须包括属和物种描述，应放置在讨论部分的末尾。同样，新的分类单元必须存放在两个公共可用的文化收藏中。比较表型和基因型特征的大数据集（例如，脂肪酸组成，底物剖面，序列相似性）或相关物种可能对新分类物的分类评估可能具有价值，通常应放置在补充材料中。该论文将要放置的期刊的部分将取决于新分类单元的性质及其隔离环境的性质。

该期刊中科院分区基础版为2区，升级版为2区，最新期刊影响因子为5.005. 本期刊所在地为美国，隶属于美国微生物学会(American Society for Microbiology)，每年24期。

期刊的五年影响因子变化情况，该期刊影响因子逐年上升，最新数据为5.005。

按照影响因子来看，该期刊在生物技术与应用微生物学期刊中，位居第46名。

按照影响因子来看，该期刊在微生物学期刊中，位居第53名。

根据引用半衰期数据，该期刊自引率较低，另外，在2012年，被引用表现更好。

三年内，全球发文数量排名：

第一是欧洲研究型大学联盟（LERU），

第二是中科院，

第三是美国加利福尼亚大学系统，

第四是美国能源部（DOE），

第五是UDICE法国研究型大学联盟协会，

第六是美国农业部（USDA），

第七是法国国家农业食品与环境研究院(INRAE)，

第八是法国国家科学研究中心（CNRS）。

三年内，按照国家发文量排序：

第一是美国，

第二是中国，

第三是德国，

第四是日本，

第五是加拿大，

第六是法国，

第七是英国，

第八是澳大利亚，

第九是荷兰，

第十是西班牙。

网上对该期刊的投稿经历分享较少，这里列出4篇：

第一篇：

1.1 submit

1.1 initial qc

1.6 under review 

半个月外审不到，就出结果了，被拒

第二篇：

微生物领域口碑非常好的期刊，审稿人很专业，

来来回回四五趟修稿接收，

每次都是40d（天）回的审稿意见

第三篇：

em和aem是大多数环境微生物人的两大梦想期刊，

如同环境人的est和wr，非常开心能够被aem接收。

审稿意见非常苛刻，专业，可以感受到都是业内有想法牛人，

不过在影响因子暴涨的气候下，作为美国微生物学会旗下期刊，

aem影响因子基本处于躺平的状态，

这可能也跟美国微生物学会公开声明抵制弃用影响因子有关系。

期刊只关注论文本身，不关注影响因子，也算是一股清流。

第四篇：

2019.12.27 submit

2020.2.6 reject with resubmitting the manuscript

2020.5.2 resubmit (new manuscript id was assigned)

2020.6.1 modify

2020.6.25 resubmit

2020.7.3 accept

综合来看，编辑处理速度较快，审稿人处理效率较好，整体上的处理时效性较好。

各位朋友手边如果有相关的研究成果，小编建议试试。

本期刊非OA期刊，但接收后可能涉及版面费（有基金项目支持的研究）。

投稿链接：

https://aem.msubmit.net/cgi-bin/main.plex

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